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학술저널
저자정보
Suhda, Saihas (Biomedical Science, Faculty of Medicine, Universitas Gadjah Mada) Paramita, Dewi Kartikawati (Histology and Cell Biology, Faculty of Medicine, Universitas Gadjah Mada) Fachiroh, Jajah (Histology and Cell Biology, Faculty of Medicine, Universitas Gadjah Mada)
저널정보
아시아태평양암예방학회 Asian Pacific journal of cancer prevention : APJCP Asian Pacific journal of cancer prevention : APJCP 제17권 제7호
발행연도
2016.1
수록면
3,065 - 3,069 (5page)

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Single nucleotide polymorphism (SNP) detection has been used extensively for genetic association studies of diseases including cancer. For mass, yet accurate and more economic SNP detection we have optimized tetra primer amplification refractory mutation system polymerase chain reaction (ARMS PCR) to detect three SNPs in the cytochrome P450 2E1 (CYP2E1) gene locus; i.e. rs3813865, rs2070672 and rs3813867. The optimization system strategies used were (1) designing inner and outer primers; (2) determining of their optimum primer concentration ratios; and (3) determining of the optimum PCR annealing temperature. The tetra primer ARMS PCR result could be directly observed using agarose gel electrophoresis. The method succesfully determined three SNPs in CYP2E1 locus, the results being consistent with validation using DNA sequencing and restriction fragment length polymorphisms (RFLP).

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