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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
정남영 (포항공과대학교) Tae-Kyung Kim (Yonsei University)
저널정보
대한생화학·분자생물학회 BMB Reports BMB Reports 제54권 제5호
발행연도
2021.1
수록면
233 - 245 (13page)

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In eukaryotes, the genome is hierarchically packed inside the nucleus, which facilitates physical contact between cis-regulatory elements (CREs), such as enhancers and promoters. Accumulating evidence highlights the critical role of higherorder chromatin structure in precise regulation of spatiotemporal gene expression under diverse biological contexts including lineage commitment and cell activation by external stimulus. Genomics and imaging-based technologies, such as Hi-C and DNA fluorescence in situ hybridization (FISH), have revealed the key principles of genome folding, while newly developed tools focus on improvement in resolution, throughput and modality at single-cell and population levels, and challenge the knowledge obtained through conventional approaches. In this review, we discuss recent advances in our understanding of principles of higher-order chromosome conformation and technologies to investigate 4D chromatin interactions.
#3D genome #4D genome #Chromatin architecture #Chromatin loop #Chromosome conformation #Genome folding #Hi-C #Higherorder chromatin structure #TAD

목차

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참고문헌 (107)

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Van Bortle K / 2012 / Nuclear organization and genome function / Annu Rev Cell Dev Biol 28:163~187 google schola Rowley MJ / 2018 / Organizational principles of 3D genome architecture / Nat Rev Genet 19:789~800 google schola Bonev B / 2016 / Organization and function of the 3D genome / Nat Rev Genet 17:661~678 google schola Zheng H / 2019 / The role of 3D genome organization in development and cell differentiation / Nat Rev Mol Cell Biol 20:535~550 google schola Dekker J / 2017 / The 4D nucleome project / Nature 549:219~226 google schola

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