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저자정보
Qian Liu (Chinese Academy of Sciences) Yang Liu (Chinese Academy of Sciences) Qinghua Shi (Chinese Academy of Sciences) Handong Su (Chinese Academy of Sciences) Chunhui Wang (Chinese Academy of Sciences) James A. Birchler (University of Missouri at Columbia) Fangpu Han (Chinese Academy of Sciences)
저널정보
한국유전학회 Genes & Genomics Genes & Genomics Vol.43 No.3
발행연도
2021.1
수록면
217 - 226 (10page)

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Background Centromeres are specialized chromosomal domains involved in kinetochore formation and faithful chromosome segregation. Despite a high level of functional conservation, centromeres are not identified by DNA sequences, but by epigenetic means. Universally, centromeres are typically formed on highly repetitive DNA, which were previously considered to be silent. However, recent studies have shown that transcription occurs in this region, known as centromeric-derived RNAs (cenRNAs). CenRNAs that contribute to fundamental aspects of centromere function have been recently investigated in detail. However, the distribution, behavior and contributions of centromeric transcripts are still poorly understood. Objective The aim of this article is to provide an overview of the roles of cenRNAs in centromere formation and function. Methods We describe the structure and DNA sequence of centromere from yeast to human. In addition, we briefly introduce the roles of cenRNAs in centromere formation and function, kinetochore structure, accurate chromosome segregation, and pericentromeric heterochromatin assembly. Centromeric circular RNAs (circRNAs) and R-loops are rising stars in centromere function. CircRNAs have been successfully identified in various species with the assistance of high-throughput sequencing and novel computational approaches for non-polyadenylated RNA transcripts. Centromeric R-loops can be identified by the single-strand DNA ligation-based library preparation technique. But the molecular features and function of these centromeric R-loops and circRNAs are still being investigated. Conclusion In this review, we summarize recent findings on the epigenetic regulation of cenRNAs across species, which would provide useful information about cenRNAs and interesting hints for further studies.
#Centromere · cenRNAs · Chromosome segregation · R-loop · circRNAs

목차

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Arabidopsis Genome I / 2000 / Analysis of the genome sequence of the fowering plant Arabidopsis thaliana / Nature 408:796~815 google schola Arunkumar G / 2020 / Centromeric transcription : a conserved swiss-army knife / Genes 11:911 google schola Bergmann JH / 2011 / Epigenetic engineering shows H3K4me2 is required for HJURP targeting and CENPA assembly on a synthetic human kinetochore / EMBO J 30:328~340 google schola Blower MD / 2016 / Centromeric transcription regulates aurora-B localization and activation / Cell Rep 15:1624~1633 google schola Boeger H / 2003 / Nucleosomes unfold completely at a transcriptionally active promoter / Mol Cell 11:1587~1598 google schola

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