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본 연구에서는 미생물균총에서 B. licheniformis K12 균주의 양상을 확인하기 위한 선발마커 개발을 시도하였다. Bacillus licheniformis는 바위게 내장에서 유산생산균주로써 분리되었다. 본 균주는 중온에서 성장이 양호할 뿐만 아니라 유전체 분석결과 protease, amylase, cellulase, lipase, protease, xylanase 등 다양한 고분자 물질들을 분해할 수 있는 효소류들을 보유하고 있는 것으로 나타났다. 선발마커 발굴을 위해 recombinase, integrase, transposase, phage-related genes, bacteriocin 등 유전자 변이 유발이 쉬운 게놈상의 영역에 대해 탐색을 실시하였다. 그 결과, 선발마커로써 가능성이 높은 5개 부위를 확보하였다. 후보마커는 recombinase 부위 3개(BLK1, 2, 3) integrase 부위 1개(BLK4), phase 관련 1개(BLK5)로 나타났다. 후보 선발마커로써 Bacillus species가 다른 B. licheniformis, B. velezensis, B. subtilis, B. cereus 등에 대해 PCR 분석을 실시하였다. 그 결과 BLK1 recombinase, BLK2 recombinase family protein, BLK4 site-specific integrase 등에서 B. licheniformis에서 특이적인 위치에 PCR 산물이 나타나는 것을 확인하였다. 또한, B. licheniformis 표준균주로써 subspecies에 대한 PCR을 수행한 결과 BLK1 및 3이 선발마커로써 양호한 것으로 나타났다. 따라서 BLK1이 미생물균총에서 종(species) 및 아종(subspecies) 선발마커로써 활용 가능할 것으로 판단된다.
목차
서론
재료 및 방법
결과 및 고찰
References
초록
참고문헌 (23)
참고문헌 신청
Albuquerque, P., Caridade, C. M. R., Rodrigues, A. S., Marçal, A. R. S., Cruz, J., Cruz, L., Santos, C. L., Mendes, M. V. and Tavares, F. 2012. Evolutionary and experimental assessment of novel markers for detection of Xanthomonas euvesicatoria in plant s
Almeida, E. 2014. Bacillus licheniformis specific DNA markers for identification and culture-independent monitoring. Doctorial thesis.
Chen, V., Griffin, M. E., Maguin, P., Varble, A. and Hang, H. C. 2021. RecT Recombinase expression enables efficient gene editing in Enterococcus spp. Appl. Environ. Microbiol. 87, e0084421.
de Boer, A. S., Priest, F. and Diderichsen, B. 1994. "On the industrial use of Bacillus licheniformis: a review". Appl. Microbiol. Biotechnol. 40, 595-598.
Elsababty, Z. E., Abdel-Aziz, S. H., Ibrahim, A. M., Guirgis, A. A. and Dawwam, G. E. 2022. Purification, biochemical characterization, and molecular cloning of cellulase from Bacillus licheniformis strain Z9 isolated from soil. J. Genet. Eng. Biotechnol.
Almeida, E. 2014. Bacillus licheniformis specific DNA markers for identification and culture-independent monitoring. Doctorial thesis.
Chen, V., Griffin, M. E., Maguin, P., Varble, A. and Hang, H. C. 2021. RecT Recombinase expression enables efficient gene editing in Enterococcus spp. Appl. Environ. Microbiol. 87, e0084421.
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