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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
이동근 (신라대학교) 이상현 (신라대학교)
저널정보
한국생명과학회 생명과학회지 생명과학회지 제25권 제9호
발행연도
2015.9
수록면
1,007 - 1,013 (7page)

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원핵생물체의 생명유지에 중요한 역할을 담당하는 유전자들을 밝히기 위해 미생물 유전체들 사이의 공통적 유전자를 파악하는 COG 알고리즘을 이용하였다. 원핵생물 711종 모두에 보존적인 것은 COG0080 (Ribosomal protein L11) 1개였다. 708종 이상의 원핵생물에 보존적인 22개의 ortholog 중 전사관련 2개, tRNA synthetase 관련 4개, ribosamal large subunit 8개, ribosomal small subunit 7개였다. 700종 이상의 원핵생물에 보존적인 COG는 58개였다. 이중 리보좀을 구성하는 소단위체 등 번역 관련 COG가 50개(86.2%), 전사관련 COG가 4개(6.9%)로 나타나 생명현상에서의 단백질의 중요성을 알 수 있었다. 58개의 COG 중 보존성은 COG0060 (Isoleucyl tRNA synthetase)이 가장 높았고 COG0143 (Methionyl tRNA synthetase)이 가장 낮았다. 문(phylum)과 강(class) 수준에서 보존적 유전자들의 평균과 분산으로 유전체 분석을 수행한 결과 변이가 큰 고세균은 진정세균과 구분되었으며 편차는 일부 진정세균이 고세균보다 컸다. 보존적 유전자를 탐색하는 본 연구의 기법은 기초과학 연구와 함께 항균제 개발과 항암요법 개발 등에도 유용할 것이다.
#Conservative gene #COG (cluster of orthologous groups of protein) #ortholog #prokaryotic genome

목차

서론
재료 및 방법
결과 및 고찰
References
초록

참고문헌 (18)

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[학술지(정기간행물)] - Bapteste, E. / 2004 / Phylogenetic reconstruction and lateral gene transfer / Trends Microbiol 12 : 406 ~ 411 google schola [학술지(정기간행물)] - Bhat, K. P. / 2004 / Essential role of ribosomal protein L11 in mediating growth inhibition-induced p53 activation / EMBO J 23 : 2402 ~ 2412 google schola [인터넷자원] - / / ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pub/COG/COG2014/data google schola [학술지(정기간행물)] - Galperin, M. Y. / 2015 / Expanded microbial genome coverage and improved protein family annotation in the COG database / Nucleic Acids Res 43 : D261 ~ D269 google schola [인터넷자원] - / / http://en.wikipedia.org/wiki/ google schola

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