지원사업
학술연구/단체지원/교육 등 연구자 활동을 지속하도록 DBpia가 지원하고 있어요.
커뮤니티
연구자들이 자신의 연구와 전문성을 널리 알리고, 새로운 협력의 기회를 만들 수 있는 네트워킹 공간이에요.
초록· 키워드
오류제보하기
고세균 유전체들 사이의 공통적 유전자를 파악하는 archaeal clusters of orthologous genes (arCOG) 알고리즘으로, 168 균주의 고세균들에 공통적인 보존적 유전자를 파악하고자 하였다. 보존된 ortholog의 수는 168, 167, 166 및 165 균주에서 각각 14, 10, 9 및 8개였다. 이들 41개의 arCOG 중에서 번역, 리보솜 구성 및 생합성에 관련된 arCOG가 13개로 가장 많았고 DNA의 복제와 재조합 및 수복에 관련된 arCOG가 10개로 다음으로 많았다. 168개의 고세균 균주들에 보존적인 14개의 arCOG들은 tRNA synthetase가 6개로 가장 많았다. 리보솜과 반응, tRNA 합성, DNA 복제, 전사와 관련한 arCOG가 각 2개씩으로 고세균에서 단백질 발현의 중요성을 알 수 있었다. 보존적 arCOG 구성원들의 distance value의 평균으로 3개 이상의 구성원을 가지는 강(class)과 목(order) 수준에서 유전체를 분석한 결과, Euryarchaeota 문의 Archaeoglobi 강과 Thermoplasmata 강이 각각 최저치와 최고치를 나타내었다. 본 연구는 기초과학 연구와 함께 항균제 개발 및 종양 제어 등에 필요한 자료를 제공할 수 있을 것이다.
목차
서론
재료 및 방법
결과 및 고찰
References
초록
참고문헌 (17)
참고문헌 신청
de Crecy-Lagard, V., Brochier-Armanet, C., Urbonavicius, J., Fernandez, B., Phillips, G., Lyons, B., Noma, A., Alvarez, S., Droogmans, L., Armengaud, J. and Grosjean, H. 2010. Biosynthesis of wyosine derivatives in tRNA: an ancient and highly diverse pathway in Archaea. Mol. Biol. Evol. 27, 2062- 2077.
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pub/wolf/COGs/arCOG
Galperin, M. Y., Kristensen, D. M., Makarova, K. S., Wolf, Y. I. and Koonin, E. V. 2019. Microbial genome analysis: the COG approach. Brief Bioinform. 20, 1063-1070.
Kang, H. Y., Shin, C. J., Kang, B. C., Park, J. H., Shin, D. H., Choi, J. H., Cho, H. G., Cha, J. H., Lee, D. G., Lee, J. H., Park, H. K. and Kim, C. M. 2002. Investigation of conserved gene in microbial genomes using in silico analysis. J. Life Sci. 5, 610-621.
Kelch, B. A., Makino, D. L., O'Donnell, M. and Kuriyan, J. 2012. Clamp loader ATPases and the evolution of DNA replication machinery. BMC Biol. 10, 34.
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pub/wolf/COGs/arCOG
Galperin, M. Y., Kristensen, D. M., Makarova, K. S., Wolf, Y. I. and Koonin, E. V. 2019. Microbial genome analysis: the COG approach. Brief Bioinform. 20, 1063-1070.
Kang, H. Y., Shin, C. J., Kang, B. C., Park, J. H., Shin, D. H., Choi, J. H., Cho, H. G., Cha, J. H., Lee, D. G., Lee, J. H., Park, H. K. and Kim, C. M. 2002. Investigation of conserved gene in microbial genomes using in silico analysis. J. Life Sci. 5, 610-621.
Kelch, B. A., Makino, D. L., O'Donnell, M. and Kuriyan, J. 2012. Clamp loader ATPases and the evolution of DNA replication machinery. BMC Biol. 10, 34.
함께 읽어보면 좋을 논문
논문 유사도에 따라 DBpia 가 추천하는 논문입니다. 함께 보면 좋을 연관 논문을 확인해보세요!
-
원핵생물 711종의 보존적 유전자 탐색
생명과학회지
2015 .09
-
고세균 122종의 보존적 COG pathways와 유전자
생명과학회지
2023 .11
-
원핵생물 1,309종의 보존적 유전자
생명과학회지
2022 .06
-
고세균 471종의 보존적 대사경로
생명과학회지
2024 .08
-
Orthologs 수가 적은 원핵생물들의 보존적 유전자
생명과학회지
2017 .06
-
Draft genome sequence of a Sneathiella sp. HT1-7, isolated from coastal seawater
미생물학회지
2021 .12
-
동일한 속 원핵생물들의 보존 유전자와 대사경로
생명과학회지
2019 .01
-
Draft genome sequence of the polysaccharide degrading bacterium Cytophagaceae strain SJW1-29
미생물학회지
2020 .12
-
기계학습 접근법에 기반한 유전자 선택 방법들에 대한 리뷰
응용통계연구
2022 .10
-
Draft genome sequence of an algicidal bacterium Halobacillus sp. Nhm2S1
미생물학회지
2021 .09
-
소의 경제형질 관련 유전자 네트워크 분석 시스템 구축
생명과학회지
2016 .08
-
독립영양 방식으로 퍼클로레이트를 분해하는 농화배양 내 고세균 군집 분석
생명과학회지
2017 .04
-
Draft genome sequence of Weizmannia coagulans BA375 isolated from saltern soil in Korea
미생물학회지
2021 .06
-
Pan-Genomics of Lactobacillus plantarum Revealed Group-Specific Genomic Profiles without Habitat Association
Journal of Microbiology and Biotechnology
2018 .01
-
Whole genome of strain RR4-35, a novel bacterium in the family Rhodobacteraceae
미생물학회지
2021 .03
-
Complete genome sequence of Parasphingopyxis sp. CP4, an asparaginase-producing marine bacterium
미생물학회지
2020 .12
-
Discovery of a tRNA-like base sequence in the coronavirus genome and possible mechanism of action
Genes & Genomics
2022 .11
-
국내 애기박쥐과 박쥐들의 미토콘드리아 유전체 염기서열 내 씨퀀스 보존지역
국립공원연구지
2015 .07
-
Complete genome sequence of triclosan-resistant Pseudomonas sp. Tri1, isolated from farmland soil, South Korea
미생물학회지
2021 .06
-
Complete genome sequence of Staphylococcus aureus 24EBSta0529 isolated from stream water, South Korea
미생물학회지
2024 .09
이 논문의 저자 정보
이 논문과 함께 이용한 논문
최근 본 자료
댓글(0)
0