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자료유형
학술저널
저자정보
Yoursry Hawash (Taif University) M. M. Ghonaim (Taif University) S. S. Al-Shehri (Taif University)
저널정보
대한기생충학열대의학회 Parasites, Hosts and Diseases The Korean Journal of Parasitology Vol.54 No.1
발행연도
2016.2
수록면
1 - 8 (8page)

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Laboratory workers, in resource-poor countries, still consider PCR detection of Giardia lamblia more costly and more time-consuming than the classical parasitological techniques. Based on 2 published primers, an in-house one-round touchdown PCR-RFLP assay was developed. The assay was validated with an internal amplification control included in reactions. Performance of the assay was assessed with DNA samples of various purities, 91 control fecal samples with various parasite load, and 472 samples of unknown results. Two cysts per reaction were enough for PCR detection by the assay with exhibited specificity (Sp) and sensitivity (Se) of 100% and 93%, respectively. Taking a published small subunit rRNA reference PCR test results (6%; 29/472) as a nominated gold standard, G. lamblia was identified in 5.9% (28/472), 5.2%, (25/472), and 3.6% (17/472) by PCR assay, RIDA<SUP>®</SUP> Quick Giardia antigen detection test (R-Biopharm, Darmstadt, Germany), and iodine-stained smear microscopy, respectively. The percent agreements (kappa values) of 99.7% (0.745), 98.9% (0.900), and 97.7% (0.981) were exhibited between the assay results and that of the reference PCR, immunoassay, and microscopy, respectively. Restriction digestion of the 28 Giardia-positive samples revealed genotype A pattern in 12 and genotype B profile in 16 samples. The PCR assay with the described format and exhibited performance has a great potential to be adopted in basic clinical laboratories as a detection tool for G. lamblia especially in asymptomatic infections. This potential is increased more in particular situations where identification of the parasite genotype represents a major requirement as in epidemiological studies and infection outbreaks.
#Giardia lamblia #PCR-RFLP #genotype #asymptomatic human infection

목차

Abstract
INTRODUCTION
MATERIALS AND METHODS
RESULTS
DISCUSSION
REFERENCES

참고문헌 (37)

참고문헌 신청
Robertson LJ. Introduction to Giardia duodenalis: the parasite and the disease. In Giardia as a foodborne pathogen. New York. USA. Springer. 2013, pp. 1-7. google schola Monis PT, Caccio SM, Thompson RC. Variation in Giardia: towards a taxonomic revision of the genus. Trends Parasitol 2009; 25: 93-100. google schola Cacciò SM, Sprong H. Epidemiology of giardiasis in humans. Vienna, Austria. Springer. 2011, pp. 17-28. google schola Pallant L, Barutzki D, Schaper R, Thompson RC. The epidemiology of infections with Giardia species and genotypes in well cared for dogs and cats in Germany. Parasit Vectors 2015; 8: 2. google schola Foronda P, Bargues MD, Abreu-Acosta N, Periago MV, Valero MA, Valladares B, Mas-Coma S. Identification of genotypes of Giardia intestinalis of human isolates in Egypt. Parasitol Res 2008; 103: 1177-1181. google schola

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UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2016-513-002569585