Scolopendrasin I: a novel antimicrobial peptide isolated from the centipede Scolopendra subspinipes mutilans

황재삼

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자료유형: 학술저널

저자정보: 황재삼

저널정보: 한국잠사학회 International Journal of Industrial Entomology International Journal of Industrial Entomology 제31권 제1호

발행연도: 2015.1

수록면: 14 - 19 (6page)

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In a previous report, we identified several candidate antimicrobial peptides through de novo RNA sequencing of the centipede Scolopendra subspinipes mutilans . Here, we identify and characterize one of these peptides, Scolopendrasin I. We identified the centipede antimicrobial peptide Cecropin from the centipede transcriptome using an SVM algorithm, and subsequently analyzed the amino acid sequence for predicted secondary structure using a GOR algorithm. We identified an alpha helical region of Cecropin and named it Scolopendrasin I. We then assessed antimicrobial and hemolytic activity of Scolopendrasin I. Scolopendrasin I showed antimicrobial activity against various microbes, including antibiotic-resistant Gram-negative bacteria, in a radial diffusion assay. Scolopendrasin I had potent antibacterial activity against acne-associated microbes in a colony count assay and showed no hemolytic activity in a hemolysis assay. In addition, we confirmed that Scolopendrasin I bound to the surface of bacteria via a specific interaction with lipoteichoic acid and lipopolysaccharide, two components of bacterial cell membranes. In conclusion, the results presented here provide evidence that this is an efficient strategy for antimicrobial peptide candidate identification and that Scolopendrasin I has potential for successful antibiotic development.

#antimicrobial peptide #SVM algorithm #α-Helical #Scolopendra subspinipes mutilans #Scolopendrasin I

참고문헌 (17)

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Boman HG / 2003 / Antibacterial peptides: basic facts and emerging concepts / J Intern Med 254 : 197 ~ 215

Ding Z / 1997 / Medicinal insects in China / Ecol Food Nutr 36 : 209 ~ 220

Fjell CD / 2012 / Designing antimicrobial peptides: form follows function / Nat Rev Drug Discov 11 : 37 ~ 51

Garnier J / 1996 / GOR method for predicting protein secondary structure from amino acid sequence / Methods Enzymol 266 : 540 ~ 553

Hancock RE / 1999 / Peptide antibiotics / Antimicrob Agents Chemother 43 : 1317 ~ 1323

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