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저자정보
서보윤 (국립농업과학원 작물보호과) 박창규 (국립농업과학원 작물보호과) 고영호 (한림대학교 일송생명과학연구소) 정진교 (국립식량과학원 재배환경과) 조점래 (국립농업과학원 작물보호과) 강찬영 (국립농업과학원 작물보호과)
저널정보
한국응용곤충학회 한국응용곤충학회지 한국응용곤충학회지 제56권 제4호
발행연도
2017.1
수록면
377 - 385 (9page)

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멸구과(Delphacidae) 8종의 internal transcribed spacer 2 (ITS2) DNA 염기서열로 종간 차이 추정값을 비교하고 분자계통수를 추론하였다. ITS2 DNA 염기서열 길이는 종(species)마다 550 bp (흰등멸구)에서 699 bp (겨풀멸구)까지 차이를 보였다. 같은 Nilaparvata 속의 겨풀멸구와 벼멸구붙이 사이의 염기서열 차이 추정값($d{\pm}S.E.$)은 $0.001{\pm}0.001$로 가장 낮았으며, 사슴멸구와 일본멸구 사이는 $0.579{\pm}0.021$로 가장 높았다. 벼멸구와 다른 멸구류들과의 종간 염기서열 차이 추정값은 $0.056{\pm}0.008$ (겨풀멸구)에서부터 $0.548{\pm}0.021$ (일본멸구)로 구분되었다. 반면, Neighbor-joining 방법으로 추론된 분자계통수에서는 겨풀멸구와 벼멸구붙이를 제외하고 나머지 멸구류들은 독립된 다른 그룹으로 분지되었다. 벼멸구의 ITS2 염기서열을 참고하여 벼멸구 특이 고리매개등온증폭(loop-mediated isothermal amplification, LAMP) 프라이머 4 세트(BPH-38, BPH-38-1, BPH-207 및 BPH-92)를 제작하였다. 이들 각각을 벼멸구, 흰등멸구 및 애멸구의 게놈 DNA와 $65^{\circ}C$에서 60분간 반응시켰을 때, 벼멸구 시료에서만 증폭 산물들이 관찰되었다. BPH-92 LAMP 프라이머 세트로 $65^{\circ}C$에서 벼멸구 DNA의 양(0.1 ng, 1 ng, 10 ng, 100 ng)과 반응시간(20분, 30분, 40분, 60분)을 달리하여 형광반응을 관찰하였을 때, 20분과 30분 반응에서는 100 ng 까지에서도 발광여부 구별이 어려웠다. 그러나 40분 반응에서는 10 ng 이상에서, 60분 반응에서는 0.1 ng 이상에서 발광여부가 명확히 구별되었다.
#멸구류 #벼멸구 #염기서열 차이 #고리매개등온증폭

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참고문헌 (16)

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Bonizzoni, M / 2009 / Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) for rapid identification of Anopheles gambiae and Anopheles arabiensis mosquitoes / Am. J. Trop. Med. Hyg 81:1030~1034 google schola Cabauatan, P.Q / 2009 / Planthoppers: new threats to the sustainability of intensive rice production systems in Asia / International Rice Research Institute :357~368 google schola Dickey, A.M / 2013 / Identification of the Meam1 cryptic species of Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae) by loop-mediated isothermal amplification / Fla. Entomol 96:756~764 google schola Hillis, D.M / 1991 / Ribosomal DNA: molecular evolution and phylogenetic inference / Q. Rev. Biol 66:411~426 google schola 김황용 / 2002 / 논에 설치한 유아등에 채집되는 멸구류 동정을 위한 하이퍼텍스트 기반검색표 개발 / 한국응용곤충학회지 41(2):75~83 dbpia

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